Po	No.	Machine		Driver	Best Time	Diff	Tire	WH
1	32	EPSON NSX	s	ロイック・デュバル* 中山 友貴	1'45.842	155.201 km/h	DL	9
2	12	IMPUL カルソニック GT-R	s	松田 次生* セバスチャン・フィリップ	1'46.032	0'00.190	BS	32
3	1	MOTUL AUTECH GT-R	s	本山　哲 ブノワ・トレルイエ*	1'46.006	0'00.224	BS	48
4	8	ARTA NSX	s	ラルフ・ファーマン* 伊沢 拓也	1'46.182	0'00.340	BS	33
5	18	ROCKSTAR 童夢 NSX	s	道上 龍 小暮 卓史*	1'46.223	0'00.381	BS	40
6	6	ENEOS SC430	s	伊藤 大輔* ビヨン・ビルドハイム	1'46.271	0'00.429	BS	20
7	24	HIS ADVAN KONDO GT-R	s	J.P・デ・オリベイラ* 荒 聖治	1'46.314	0'00.472	YH	37
8	36	PETRONAS TOM'S SC430	s	脇阪 寿一 アンドレ・ロッテラー*	1'46.362	0'00.520	BS	42
9	100	RAYBRIG NSX	s	井出 有治* 細川 慎弥	1'46.475	0'00.623	BS	21
10	17	KEIHIN NSX		金石 年弘 塚越 広大*	1'46.719	0'00.877	BS	32
11	35	KRAFT SC430	s	石浦 宏明* 大嶋 和也	1'46.991	0'01.149	BS	34
12	39	DUNLOP SARD SC430		アンドレ・クート* 平手 晃平	1'47.084	0'01.242	DL	21
13	38	ZENT CERUMO SC430	s	立川 祐路* リチャード・ライアン	1'47.253	0'01.411	BS	40
14	3	HASEMI TOMICA EBBRO GT-R		ロニー・クインタレッリ* 安田 裕信	1'47.881	0'02.039	MI	41
15	21	ASTON MARTIN 赤坂 DBR9		都筑 晶裕 土屋 武士*	1'48.949	0'03.107	YH

上位8台は、スーパーラップ選抜車両

□タイヤ＝BS：ブリヂストン／DL：ダンロップ／HK：ハンコック／KH：クムホ／MI：ミシュラン／YH：ヨコハマ
□WH＝ウェイトハンディキャップ（kg）
□*＝タイムを出したドライバー／ #付のドライバーは通過基準タイム不足
○車名の後ろのＳ:シード権車両＝シード権車両は、全ての参加条件が満たされている限り決勝レースへの出場が保証される。
※No.8　2009 SUPER GT Sporting Regulations第3章第12条9.公式予選終了前にエンジンを交換したため、予選結果に対し10グリッド降格とする。
※No.39　Aドライバーは、2009年富士スピードウェイ一般競技規則第9章第39条1.違反(ピット入口のホワイトラインカット)により、ベストラップタイム削除及び訓戒とする。